Publicar varios proyectos en diferentes ubicaciones en el sitio web de Azure

¡No dude en recomendar un título mejor o cambios en mi explicación a continuación!

Estoy usando sitios web de Windows Azure (por primera vez) y lo he conectado a una solución en Visual Studio Online (también la primera vez). También pude conectarme a Visual Studio Online, crear un proyecto, lanzar una página maestra y un formulario web conectado a una página maestra y mi sitio web Azure se actualizó a sí mismo. ¡Estupendo!

• Copie un archivo en el directorio de destino en implementación desde los servicios del equipo visual studio
• Eliminar archivos y foldes en Azure antes de una nueva implementación de VSTS
• Cómo hacer que TFS2015 Build (Build.vnext) y restaurar el paquete NuGet usen fonts de paquetes personalizados
• C # 6.0 TFS Builds

Mi problema

Si agrego otro proyecto a la solución, parece que este nuevo proyecto sobrescribe los archivos en el primero. No puedo encontrar la manera de configurar esto así:

Proyecto 1 -> implementar en wwwroot (¡por defecto es genial!)

Proyecto 2 -> implementar en wwwroot / sub / directory / (no parece funcionar)

¿Podría alguien explicar cómo configurar el proyecto 2 para que cuando la solución se implemente automáticamente en un sitio web de Azure vaya a una ubicación específica?